Ha pasado aproximadamente un año desde los eventos de Blaster Master Zero 3, cuando Jason y Eve desaparecieron final bueno. Desde entonces, su equipo informó al Gobierno Mundial sobre lo sucedido
Los gobiernos mundiales de la Tierra se dieron cuenta de que la situación era crítica: los mutantes habían conquistado varios planetas. De no haber sido por la ayuda de Jason y Eve, reconocidos como héroes por defender el sistema, el destino para ellos dos sea incierto cuando pasaron ambos a la puerta al espacio extra dimensiona. En su honor, se decidió fundar la organización SOPHIA Earth Defense acrónimo (SED) , nombrada así en homenaje al vehículo que pilotaba Jason. Como parte de este homenaje, se comenzó a fabricar en masa dicha nave y tanque de batalla.
Era el inicio de una nueva era. Naufumi Iguatani era un Pilotos recién graduados de la academia con honores se unían al programa, aunque este aún era muy reciente. Para muchos, la idea resultaba abrumadora.de repente nave chocó
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