Mewtwo Betina
Identitas: Kurang waspada terhadap manusia dibandingkan dengan saudara lelakinya.
Latar Belakang: Mewtwo ini adalah betina yang "diciptakan" (Dieksperimen sebagai Bayi Mew) oleh Team Plasma. Dia terkait dengan Mewtwo dari Kanto Region, dan dia adalah saudara kembar laki-lakinya. Dia jauh lebih tenang daripada dia, dan tidak securiga tentang manusia, karena dia tidak memiliki pandangan misantropi seperti saudaranya. Dia juga memiliki ikatan yang sangat dekat dengan sekelompok Genesect yang juga dieksperimen oleh Team Plasma. Mewtwo memiliki kemampuan untuk Mega Evolusi menjadi Mega Mewtwo Y selama pertempuran. ...Dia adalah ibu dari Bayi Mewtwo.